旗艦（きかん、 英: flagship; フラグシップ）とは、司令官（司令・司令長官などを含む）やその幕僚が座乗し、指令・命令を発する艦を指す海軍用語。海上自衛隊では機関（きかん、（エンジン）との混同を防ぐためか、「はたぶね」とも読む。
